Ostrobothnia Australis' naturvetenskapliga samlingar är basen för det museum som föreningen drev åren 1933-2000. Numera handhas samlingarna av Österbottens museum och en del av dem kan ses på Terranova som presenterar Kvarkens skärgårdsnatur. Den naturvetenskapliga basutställningen kan beskådas under Österbottens museums normala öppehållningstider eller enligt överenskommelse med dess naturvetenskapliga intendent. OA:s samlingar innehåller bland annat följande katalogiserade helheter: